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研究者総覧 Researchers Information 検索 English 研究者総覧 所属別一覧 研究分野別一覧 詳細検索 使い方 お問い合わせ 土屋 貴穂(ツチヤ タカホ) 所属 医学医療系 職名 助教 ORCID 0000-0001-7540-5115 科研費番号 70853167 URLhttps://sites.google.com/view/ozakilab-jp eメール)K8B8?FcKJL:?@P8ZieD;cKJLBL98c8:cAG 研究室バイオインフォマティクス研究室（尾崎遼研究室） 研究分野生命・健康・医療情報学システムゲノム科学 研究キーワード情報生命科学システムバイオロジーバイオインフォマティクス 研究課題2型糖尿病の代謝アダプテーション2020-04 -- 2022-03黒田真也日本学術振興会/科学研究費補助金 新学術領域研究（研究領域提案型）4,937,182円1細胞空間トランスクリプトームによる細胞内と細胞間の統合ネットワーク推定手法開発2020-04 -- 2023-03土屋貴穂日本学術振興会/科学研究費補助金 若手研究4,160,000円集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計法の確立2019-08 -- 2021-03土屋貴穂日本学術振興会/科学研究費補助金 研究活動スタート支援2,860,000円集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計手法の確立2019-08 -- 2020-03土屋貴穂筑波大学/筑波大学研究基盤支援プログラム（Aタイプ）1,000,000円シグナル伝達の時間パターンから解明するリガンド選択的な遺伝子発現機構2014-04 -- 2017-03土屋貴穂日本学術振興会/科学研究費補助金 特別研究員奨励費（DC1）3,200,000円 職歴2019-05 -- (現在)筑波大学人工知能科学センター2019-05 -- (現在)筑波大学医学医療系 生命医科学域 バイオインフォマティクス研究室助教2017-04 -- 2019-03アステラス製薬株式会社アソシエイト2014-04 -- 2017-03日本学術振興会特別研究員（DC1） 学歴2014-04 -- 2017-03東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻 博士課程2012-04 -- 2014-03東京大学大学院 理学系研究科 生物化学専攻 修士課程2007-04 -- 2012-03京都大学 理学部 取得学位2018-03博士（理学）東京大学 免許資格等2014-08東京大学Future Faculty Program（Faculty Development）修了 所属学協会 -- (現在)日本バイオインフォマティクス学会 受賞2021-09第10回 生命医薬情報学連合大会（IIBMP2021）Poster Award2020-09第9回 生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）Poster Award2014-0915th International Conference on Systems Biology Student Bursary Award 論文CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cellsTsuchiya Takaho; Hori Hiroki; Ozaki HarukaBioinformatics (Oxford, England)/38(21)/pp.4868-4877, 2022-09-05PubMedIn vivo transomic analyses of glucose-responsive metabolism in skeletal muscle reveal core differences between the healthy and obese statesKokaji Toshiya; Eto Miki; Hatano Atsushi; Yugi Katsuy...Scientific reports/12(1), 2022-08-12PubMedIdentifying potential regulators of JAGGED1 expression in portal mesenchymal cellsNishino Teppei; Yoshihara Masaharu; Nakayama Takahiro; Ts...BMC Rearch Notes/15(1), 2022-05-13PubMed Tsukuba RepositoryMOCCS profile analysis clarifies the cell type dependency of transcription factor-binding sequences and cis-regulatory SNPs in humansTahara Saeko; Tsuchiya Takaho; Matsumoto Hirotaka; Ozaki ...bioRxiv, 2022-04ゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに基づく遺伝子治療土屋 貴穂BIO Clinica/Vol.36(5)/pp.448-452, 2021-04Trans-Omic Analysis Reveals Obesity-Associated Dysregulation of Inter-Organ Metabolic Cycles between the Liver and Skeletal MuscleEgami Riku; Kokaji Toshiya; Hatano Atsushi; Yugi Katsuyu...iScience/24(3), 2021-02PubMedゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに基づいた遺伝子治療の展望土屋 貴穂Precision Medicine/Vol.4(2)/pp.167-171, 2021-02Transomics analysis reveals allosteric and gene regulation axes for altered hepatic glucose-responsive metabolism in obesityKokaji Toshiya; Hatano Atsushi; Ito Yuki; Yugi Katsuy...Science Signaling/13(660), 2020-12PubMed遺伝子治療のためのゲノム編集技術と集団ゲノムデータ土屋 貴穂Medical Science Digest/Vol.46(12)/pp.766-770, 2020-10集団ゲノムデータから展望する遺伝子治療とプレシジョンメディシンの動向土屋 貴穂Precision Medicine/Vol.3(10)/pp.630-634, 2020-09Stability of RNA sequences derived from the coronavirus genome in human cellsWakida Hiroyasu; Kawata Kentaro; Yamaji Yuta; Hattori Em...Biochemical and Biophysical Research Communications/527(4)/pp.993-999, 2020-07PubMed集団ゲノムデータに基づくことによる遺伝子治療の展望土屋 貴穂Precision Medicine/Vol.3(6)/pp.581-585, 2020-05ゲノム編集技術を用いた遺伝子治療の開発動向内田 恵理子; 平松 直人; 犬飼 直人; 岩井 謙一; 渡辺 武志; 川崎 秀吉; 田村 幸太朗; 土屋 貴穂...医薬品医療機器レギュラトリーサイエンス/Vol.50(8)/pp.443-453, 2019-08System identification of signaling dependent gene expression with different time-scale dataTsuchiya Takaho; Fujii Masashi; Matsuda Naoki; Kunida ...PLoS Computational Biology/13(12), 2017-12PubMedLaguerre Filter Analysis with Partial Least Square Regression Reveals a Priming Effect of ERK and CREB on c-FOS InductionKudo Takamasa; Uda Shinsuke; Tsuchiya Takaho; Wada Ta...PLoS ONE/11(8), 2016-08PubMedRobustness of MEK-ERK Dynamics and Origins of Cell-to-Cell Variability in MAPK SignalingFilippi Sarah; Barnes Chris P; Kirk Paul D W; Kudo Ta...Cell Reports/15(11)/pp.2524-2535, 2016-06PubMed不等間隔サンプリングデータによるシステム同定のための繰り返し核ノルム最小化法小西 克巳; 土屋 貴穂; 国田 勝行; 藤井 雅史; 宇田 新介; 黒田 真也システム制御情報学会研究発表講演会講演論文集/60/p.6p, 2016-05CiNiiMultiple Low Rank Matrices Approach to Piecewise Affine System Identification for Nonuniform Sampling DataKonishi Katsumi; Tsuchiya Takaho; Kunida Katsuyuki; Masas...Proceedings of the 47th ISCIE International Symposium on Stochastic Systems Theory and Its Applications ISCIE SSS &＃39;15, 2015-12Robustness and Compensation of Information Transmission of Signaling PathwaysUda Shinsuke; Saito Takeshi H; Kudo Takamasa; Kokaji ...Science/341(6145)/pp.558-561, 2013-08PubMedシグナル伝達の時間パターンから解く初期応答遺伝子制御機構齋藤 健; 宇田 新介; 土屋 貴穂; 黒田 真也実験医学/Vol.31(8)/pp.1224-1231, 2013Temporal Decoding of MAP kinase and CREB Phosphorylation by Selective Immediate Early Gene ExpressionSaito Takeshi H; Uda Shinsuke; Tsuchiya Takaho; Ozaki ...PLoS ONE/8(3), 2013-03PubMed 会議発表等Predicting SNPs' effects on transcriptional factor binding and cell-type specificity using a crowd of ChIP-seq data田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 松本 拡高; 尾崎 遼日本人類遺伝学会第67回大会/2022-12-14--2022-12-17MOCCS-DB: ヒト転写因子認識配列の多様性データベース田原沙絵子; 土屋 貴穂; 松澤 亮輔; 尾崎遼トーゴーの日シンポジウム/2022-09-28--2022-10-05MOCCSプロファイルで明らかにする、転写因子認識配列の細胞型特異性とヒト一塩基多型が 転写因子結合へ与える影響田原沙絵子; 土屋 貴穂; 松本拡高; 尾崎遼2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022)/2022-09-13--2022-09-15CCPLS reveals cell-type specific spatial dependence of transcriptome in single cells土屋 貴穂; 尾崎 遼CREST BioDX Symposium 2021/2021-11-21--2021-11-22Cell-Cell PLS regression analysis reveals cell-type specific spatial dependency of transcriptome in single cells土屋 貴穂; 尾崎 遼日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2021）/2021-9-27--2021-9-29k-mer profile analysis clarifies cell-type specific TF binding landscape in human田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会（IBMP2021）/2021-09-27--2021-09-29ChIP-Atlasの二次解析による多彩な転写因子認識配列の解明および更なるデータベース化田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼トーゴーの日 シンポジウム 2020/2020-10-06--2020-10-06機械学習を用いたRNA安定性予測モデルの開発服部 恵美; 土屋 貴穂; 脇田 寛泰; 川田 健太郎; 山地 雄大; 和田 洋一郎; 秋光 信佳; 尾崎 遼日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会（IBMP2020）/2020-09-01--2020-09-03CellCellTopic： cell-cell interaction analysis by Dirichlet multinomial regression topic modeling土屋 貴穂; 尾崎 遼日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）/2020-09-01--2020-09-03ChIP-seqデータベースの大規模解析で解明する細胞型ごとに多彩な転写因子認識配列田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）/2020-09-01--2020-09-03System Identification of Signaling Dependent Gene Expression with Different Time-Scale Data土屋 貴穂Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University, Seminar Series of Cell Fate Dynamics & Therapeutics/2020-03-23シングルセル空間トランスクリプトームデータを用いた遺伝子制御ネットワークの空間分布解析土屋 貴穂; 尾崎遼第8回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2019）/2019-09-09--2019-09-11医薬学で応用問題を解くためのバイオインフォマティクス土屋 貴穂筑波大学 医学医療系 生命医科学域平成30年度公開講演会/2019-02-18創薬研究におけるデータサイエンス土屋 貴穂; 和田 卓也特定非営利活動法人 医学統計研究会 特定主題シンポジウム2018 ｢製薬企業におけるデータ・サイエンティストの役割｣/2018-02-03Time-Series Data-Driven Modeling approach for Temporal Decoding of Cellular Signal Transduction in differentiation of PC12 cellsTsuchiya Takaho; Kudo Takamasa; Uda Shinsuke; Wada Takum...ICSB 2014 - 15th International Conference on Systems Biology/2014-09-14--2014-09-18Fully Automated Technique for Cellular Signaling Analysis with High Temporal ResolutionTsuchiya Takaho; Takamasa Kudo; Yasunori Komori; Kuroda ...International Workshop on Quantitative Biology/2012-12--2012-12Fully Automated Technique for Cellular Signaling Analysis with High Temporal ResolutionTsuchiya Takaho; Kudo Takamasa; Komori Yasunori; Kuroda ...6th AYRCOB/2012-12--2012-12 担当授業科目2023-07 -- 2023-08バイオインフォマティクス筑波大学2022-07 -- 2022-08バイオインフォマティクス筑波大学2021-07 -- 2021-08バイオインフォマティクス筑波大学 授業以外の教育活動2019-07 -- 2019-092019年度 第1-2回 人工知能スキル研修（7月・9月） その他の活動2012 -- 20162012年度 - 2016年度 東京大学 理学部 生物化学実験I プログラミングパート ティーチングアシスタント2020-04 -- (現在)ヒューマニクス学位プログラム 授業担当教員 (最終更新日: 2024-04-10) このサイトについて | --> 筑波大学　研究推進部 〒305-8577　茨城県つくば市天王台1-1-1　 Copyright (c) University of Tsukuba All Rights Reserved.